Scipy函数库是基于python做科学和工程计算中常用的库，其中包括了众多的线性代数、数值计算、图像和信号处理、稀疏矩阵等。在基于python做脑影像处理时，scipy也是最常用到的python库之一。下面记录安装scipy的步骤，备查。

系统环境：Centos 5.7 64bit

在非root权限下，需要把库安装在自己有权限的目录下，比如采用pip提供的—user参数将默认安装到.local/lib/python2.7/site-packages/中。

安装scipy涉及到的主要命令如下：

pip install –user scipy

不过一般情况下，你会碰到如下的问题：

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Scipy网站上有说到，scipy会依赖该库，需要首先安装，安装步骤如下：

mkdir -p ~/src/
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar xzf blas.tgz
cd BLAS
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f
ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o
export BLAS=~/src/BLAS/libfblas.a

注：我使用的服务器安装的fortran编译器是gfortran，这一步根据具体情况决定。

实际上，scipy安装还依赖另一个库LAPACK，需要采用类似的方式安装：

cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz
tar xzf lapack.tgz
cd lapack-*/
cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc
make lapacklib
make clean
export LAPACK=~/src/lapack-*/libflapack.a

注：在make lapacklib之前可能需要编辑make.inc文件，将OPTS 和 NOOPT如下：OPTS = -O2 –fPIC和NOOPT = -O0 –fPIC

如此，在安装完BLAS和LAPACK后，就可以顺利安装scipy了。